La reserva abarca bañados, lagunas y costa atlántica, con dunas y playas entre sus principales atractivos. Entre los circuitos más importantes podrían mencionarse el paisaje serrano, refugio de flora y fauna en el que se pueden practicar el senderismo y las cabalgatas; las tres grandes lagunas (Negra, Castillos y Rocha), con sus espejos de agua, sus costas, sus montes de ombúes, sus palmares y sus praderas, sin olvidar las estaciones biológicas; las playas de la costa oceánica, todas con un perfil diferente y una enorme oferta de deportes náuticos, turismo aventura y paseos de todo tipo; y la ruta del arroz, que conjuga tradición y naturaleza.

La Guía Ecoturística Bañados del Este, publicada por PROBIDES (y a la vista en su página web) propone ocho circuitos que pueden servir de inspiración tanto al visitiante primerizo como a los más experimentados.